Näi­hin kuulu­vat muun muas­sa ihot­tu­mat, nivelki­vut, väsy­m­ys, kuume, rin­ta­ki­pu, hiusten­läh­tö ja munuai­son­gel­mat. Oirei­den moni­nai­su­us voi vai­keut­taa sairau­den erot­ta­mista mui­sta sairauksista. 

Lupus voi muistut­taa mui­ta auto­im­mu­uni­sairauk­sia, kuten nivel­reu­maa, Sjögre­nin oireyh­ty­mää tai fibro­my­al­giaa. Oirei­den saman­k­al­tai­su­us voi joh­taa seka­an­nuk­si­in ja vai­keut­taa diagnoosia. 

Sys­tee­mi­nen lupus ery­the­ma­to­sus kuuluu side­ku­do­s­sairauk­si­in (kol­la­ge­no­o­sei­hin). Näi­den side­ku­do­s­sairauk­si­en sisäl­lä voi aluk­si syn­tyä seka­an­nuk­sia. Oireis­sa on myös pääl­lek­käi­sy­yk­siä. Jos­kus tästä sairaus­ryh­mä­stä todeta­an kak­si dia­gno­o­sia, esim. lupus ja Sjögre­nin oireyh­ty­mä, jot­ka esi­in­ty­vät usein yhdessä.