Il s’agit notam­ment d’éruptions cuta­nées, de dou­leurs arti­cu­lai­res, de fati­gue, de fiè­v­re, de dou­leurs tho­ra­ci­ques, de per­te de che­veux et de pro­blè­mes rénaux. Cet­te diver­si­té de sym­ptô­mes peut rend­re dif­fi­ci­le la distinc­tion de la mala­die par rap­port à d’autres pathologies. 

Le lupus peut res­sem­bler à d’autres mala­dies auto-immu­nes, tel­les que la poly­ar­thri­te rhu­ma­toï­de, le syn­dro­me de Sjögren ou la fibro­my­al­gie. La simi­li­tu­de des sym­ptô­mes peut ent­raî­ner des con­fu­si­ons et com­pli­quer le diagnostic. 

Le lupus éry­thé­ma­teux sys­té­mi­que appar­tient au grou­pe des con­nec­ti­vi­tes ou col­la­gé­no­ses. Au sein de ces mala­dies du tis­su con­jonc­tif, des con­fu­si­ons peu­vent sur­ve­nir au début. Il exi­ste éga­le­ment des chevau­che­ments de sym­ptô­mes. Par­fois, deux dia­gno­stics de ce grou­pe de mala­dies sont posés, par exemp­le le lupus et le syn­dro­me de Sjögren, qui appa­rais­sent sou­vent ensemble.