Il lupus può asso­mi­glia­re ad altre malat­tie autoim­mu­ni. Ne sono un esem­pio l’artrite reu­ma­toi­de, la sin­dro­me di Sjö­gren o la fibro­mial­gia. La somi­glian­za dei sin­to­mi può por­ta­re a con­fu­sio­ne e ren­de­re più dif­fi­ci­le la diagnosi. 

Il lupus eri­te­ma­to­so siste­mi­co appar­tie­ne alle con­net­ti­vi­ti o col­la­ge­no­si. Ini­zial­men­te può esser­ci con­fu­sio­ne tra que­ste malat­tie del tes­su­to con­net­ti­vo. Esi­sto­no però anche sovrap­po­si­zio­ni dei sin­to­mi. A vol­te ven­go­no for­mu­la­te due dia­gno­si di que­sto grup­po di malat­tie. Un esem­pio è la com­par­sa simul­ta­nea di lupus e sin­dro­me di Sjögren.